More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4086 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  100 
 
 		 517 aa  1005    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  82.75 
 
 		 501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  30.23 
 
 		 432 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 417 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  50.47 
 
 		 398 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 162 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.83 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.61 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 374 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.72 
 
 		 332 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.62 
 
 		 329 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  34.71 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 308 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 315 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 236 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 342 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.15 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  31.78 
 
 		 306 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.79 
 
 		 235 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 337 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 452 aa  97.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 347 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 350 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 447 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  40 
 
 		 337 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.02 
 
 		 176 aa  94  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  41.03 
 
 		 331 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  40.16 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  35.19 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.52 
 
 		 210 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 453 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 230 aa  91.3  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.07 
 
 		 531 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 345 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 319 aa  90.1  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  47.87 
 
 		 366 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 231 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  35.25 
 
 		 283 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 160 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 234 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  35.25 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 283 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 333 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  34.68 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  44.72 
 
 		 302 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  34.68 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  35.06 
 
 		 404 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  34.68 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  34.68 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 333 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  34.68 
 
 		 273 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  42.45 
 
 		 432 aa  87.4  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 177 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 326 aa  87  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 335 aa  87  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  42.45 
 
 		 432 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 177 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  33.06 
 
 		 275 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  40 
 
 		 173 aa  86.3  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  33.06 
 
 		 271 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 177 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 190 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 177 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.98 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.91 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  33.1 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  35.38 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  34.68 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  40.8 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  32.41 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  32.41 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  38.6 
 
 		 177 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  32.41 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  34.62 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  38.28 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  34.62 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.8 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 204 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  33.99 
 
 		 407 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  38.85 
 
 		 173 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>