More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8043 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
162 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  42.96 
 
 
340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  45.22 
 
 
331 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  47.41 
 
 
349 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
306 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.03 
 
 
332 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
342 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.02 
 
 
321 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
392 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.02 
 
 
390 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.79 
 
 
337 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
160 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  49.53 
 
 
501 aa  98.2  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.11 
 
 
330 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
340 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
319 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  48.25 
 
 
417 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  41.91 
 
 
345 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
432 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
308 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4630  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
162 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
230 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  47.37 
 
 
459 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
333 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
334 aa  91.3  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
337 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  43.26 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
394 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
517 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.41 
 
 
265 aa  89.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
452 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.81 
 
 
222 aa  89  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.88 
 
 
362 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.31 
 
 
176 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  37.01 
 
 
374 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  47 
 
 
323 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  39.86 
 
 
308 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  35.37 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  39.55 
 
 
447 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
391 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.73 
 
 
372 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  44.68 
 
 
333 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
381 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.33 
 
 
531 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
337 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.19 
 
 
302 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  45.36 
 
 
350 aa  84.7  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.32 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.48 
 
 
438 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.46 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
116 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.33 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41 
 
 
453 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  45.87 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.56 
 
 
315 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  32.45 
 
 
269 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50 
 
 
335 aa  82  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
323 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
388 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  43.3 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.3 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1510  NLP/P60 protein  39.57 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.8 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  31.91 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  34.94 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  42.61 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  46.6 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  36.49 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.74 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  33.13 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
347 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.17 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  48.35 
 
 
524 aa  78.6  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  41.51 
 
 
327 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.72 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  37.98 
 
 
347 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  38.17 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  35.71 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.75 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  35.22 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  34.81 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  41.9 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  33.53 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  29.03 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>