More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0265 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  97.22 
 
 		 432 aa  820    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  100 
 
 		 432 aa  883    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  25.32 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  25.54 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  30.91 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  26.12 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  24.95 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  29.82 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.88 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  52.94 
 
 		 197 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  51.46 
 
 		 306 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.41 
 
 		 235 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.72 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  51.02 
 
 		 256 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  50.45 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  49.46 
 
 		 337 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  48.48 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  43.87 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 363 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 164 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.3 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.91 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 265 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 348 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 372 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  50.54 
 
 		 274 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  43.18 
 
 		 291 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  43.36 
 
 		 372 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 347 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  42.74 
 
 		 205 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 372 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 370 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  46.88 
 
 		 193 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 859 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 259 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 323 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  49.55 
 
 		 373 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.74 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 298 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.37 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 348 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.53 
 
 		 222 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 556 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 200 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.22 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 348 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  50.57 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 178 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.39 
 
 		 475 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.97 
 
 		 393 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  40 
 
 		 370 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  47.47 
 
 		 257 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  42.86 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  47.87 
 
 		 162 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 532 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 216 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  26.65 
 
 		 371 aa  89  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.17 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  23.13 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 532 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 517 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 236 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.92 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  27.92 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 473 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 524 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  55.17 
 
 		 297 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 334 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  26.41 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  44 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  44 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  44 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 150 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 202 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>