More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1095 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  100 
 
 
371 aa  754    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  47.33 
 
 
371 aa  309  4e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  43.19 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  36.48 
 
 
411 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  50.84 
 
 
389 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
389 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19530  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.8 
 
 
442 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000946719  hitchhiker  0.00000162886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  27.62 
 
 
409 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  27.89 
 
 
432 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
363 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  27.6 
 
 
432 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  30.29 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  28.89 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
348 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  40 
 
 
370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  27.72 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  39.69 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.8 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.49 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.49 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.43 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  42.39 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  22.75 
 
 
513 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.13 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  31.77 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  30.54 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  25.3 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.36 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  36.52 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  26.86 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  40.91 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  40.91 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  40.91 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  24.7 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  42 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  30.85 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  27.25 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.23 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  38.46 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.73 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.79 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  40 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  27.48 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  28.63 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.33 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
227 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42 
 
 
197 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  39.22 
 
 
177 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  25.66 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  39.22 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.21 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.58 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  33.51 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.16 
 
 
1048 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  22.14 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.07 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  37.96 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  40.78 
 
 
524 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.05 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  23.28 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  38.61 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  24.8 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  25.71 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  38.95 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.58 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  26.03 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  33.19 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.68 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  30 
 
 
859 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  37.74 
 
 
226 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
246 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
177 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  25.44 
 
 
432 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.88 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  40.59 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  37.23 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  31.86 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38 
 
 
205 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  37.89 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
177 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.79 
 
 
225 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.71 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.11 
 
 
208 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  35.64 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  36.11 
 
 
208 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  31.07 
 
 
501 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  36.45 
 
 
207 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>