More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1008 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  53.47 
 
 		 432 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  52.94 
 
 		 432 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 368 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.22 
 
 		 400 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  54.64 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.06 
 
 		 265 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  53.47 
 
 		 524 aa  104  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.6 
 
 		 270 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  48.08 
 
 		 476 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50.93 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  51.58 
 
 		 269 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.85 
 
 		 291 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  45.38 
 
 		 1048 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  48.7 
 
 		 257 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 366 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.37 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  47 
 
 		 256 aa  97.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.04 
 
 		 388 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  50 
 
 		 259 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 417 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 373 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 297 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 269 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 307 aa  94.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 269 aa  94.4  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 274 aa  94.4  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  39.72 
 
 		 293 aa  94  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  47 
 
 		 271 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 286 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 391 aa  92.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.62 
 
 		 173 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 317 aa  91.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 284 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  35.44 
 
 		 394 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.56 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 333 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.48 
 
 		 331 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 325 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.1 
 
 		 340 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.37 
 
 		 333 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  44.23 
 
 		 266 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 227 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 		 267 aa  88.6  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  40.74 
 
 		 273 aa  88.6  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 535 aa  88.6  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 342 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40 
 
 		 452 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 348 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  31.96 
 
 		 230 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  30.46 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  43.43 
 
 		 395 aa  87  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  37.07 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.3 
 
 		 321 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 278 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 347 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  37.61 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.68 
 
 		 261 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.13 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  42.04 
 
 		 420 aa  85.5  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  35.14 
 
 		 487 aa  85.5  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  37.2 
 
 		 325 aa  85.9  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  40.74 
 
 		 458 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 242 aa  85.5  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 473 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  41.96 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 334 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  33.08 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  37.38 
 
 		 249 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 306 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  41.9 
 
 		 333 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 370 aa  85.1  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.67 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  41.35 
 
 		 333 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  41.9 
 
 		 333 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  41.9 
 
 		 333 aa  84.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  41.9 
 
 		 333 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  41.35 
 
 		 333 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  36.45 
 
 		 257 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  40.91 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  32.53 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.21 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>