More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0643 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 487 aa  948    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  70.09 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 293 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.08 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 218 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 218 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 218 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 224 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 234 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 234 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 234 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  34.92 
 
 		 221 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 221 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  37.5 
 
 		 234 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 		 224 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.39 
 
 		 223 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 223 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 223 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 223 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 223 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 223 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 388 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 234 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 202 aa  97.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 		 291 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.91 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  47.42 
 
 		 177 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.35 
 
 		 432 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 183 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  46.67 
 
 		 177 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  35.76 
 
 		 198 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  46.81 
 
 		 327 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 330 aa  93.2  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 524 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 177 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 345 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 177 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  36.52 
 
 		 275 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  51.65 
 
 		 366 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 177 aa  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  36.52 
 
 		 271 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  36.52 
 
 		 271 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  48.11 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 177 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 417 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  34.27 
 
 		 228 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 256 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 535 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 208 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 335 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 208 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 207 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  45.74 
 
 		 181 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  40.78 
 
 		 169 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  44.79 
 
 		 178 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.24 
 
 		 393 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.74 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  32.83 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  40.21 
 
 		 187 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  34.65 
 
 		 226 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.52 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.21 
 
 		 192 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 208 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  45.74 
 
 		 181 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  41.49 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 192 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  33.62 
 
 		 324 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 256 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  24.83 
 
 		 356 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 283 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  43.01 
 
 		 201 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 369 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 259 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  34.65 
 
 		 283 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 221 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  34.65 
 
 		 283 aa  87.4  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 271 aa  87.4  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.3 
 
 		 170 aa  87.4  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  41.41 
 
 		 258 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 215 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 420 aa  87  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 197 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 367 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 375 aa  86.7  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>