More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3552 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  100 
 
 		 297 aa  551  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  85.86 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.26 
 
 		 176 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  33.67 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.25 
 
 		 261 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 392 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  44.96 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  50 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.86 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  40.87 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.31 
 
 		 1048 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  50.54 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 204 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  45.1 
 
 		 217 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42.37 
 
 		 197 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  48.45 
 
 		 337 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  52.29 
 
 		 532 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  51.72 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  52.43 
 
 		 532 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.13 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 337 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.12 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  32.97 
 
 		 476 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  36.45 
 
 		 333 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  36.45 
 
 		 333 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 178 aa  92.4  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  49.4 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  36.45 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  36.45 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 491 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  36.45 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  36.45 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  42 
 
 		 370 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  35.45 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.97 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.15 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  35.51 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  55.17 
 
 		 432 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40.5 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  55.17 
 
 		 432 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  33.75 
 
 		 188 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.39 
 
 		 388 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 235 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50.55 
 
 		 370 aa  89  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  39.74 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 341 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  41.49 
 
 		 221 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 536 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 208 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  45 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 208 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  34.58 
 
 		 333 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 216 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43 
 
 		 424 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 207 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 524 aa  86.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  38.93 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  38.93 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  38.93 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  38.93 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  38.93 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>