More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4593 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  100 
 
 
269 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  49.5 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  52.04 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
391 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
340 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  51.58 
 
 
197 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
345 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  51.49 
 
 
417 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
333 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.57 
 
 
370 aa  99  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  47.83 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
374 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
348 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.98 
 
 
372 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.98 
 
 
372 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
378 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.98 
 
 
372 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  45.28 
 
 
325 aa  95.9  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.87 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
349 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.45 
 
 
368 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  51.72 
 
 
333 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.34 
 
 
327 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.77 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
378 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.6 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.69 
 
 
1048 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  47.87 
 
 
232 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  38.41 
 
 
259 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
335 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.81 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.3 
 
 
332 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  49.51 
 
 
318 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  55.42 
 
 
286 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  47.12 
 
 
256 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.76 
 
 
334 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.81 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  36.55 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40 
 
 
348 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  41.28 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  53.54 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  38.81 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  41 
 
 
350 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
223 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  47.47 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
224 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.28 
 
 
223 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
223 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  48.75 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  38.18 
 
 
393 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  48.96 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  44.04 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.37 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
202 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.37 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
234 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  44.04 
 
 
198 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  44.04 
 
 
177 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  43.64 
 
 
211 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
323 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.19 
 
 
223 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.33 
 
 
306 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.19 
 
 
223 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  35.9 
 
 
348 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
204 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  48.57 
 
 
225 aa  88.6  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  45.74 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  36.81 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.54 
 
 
556 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  45.36 
 
 
180 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
388 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
162 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  34.51 
 
 
370 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  40.74 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  39.31 
 
 
364 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  35.9 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  38.46 
 
 
361 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  35.04 
 
 
348 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  35.9 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
361 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  51.14 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.92 
 
 
524 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.57 
 
 
269 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
240 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>