More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0285 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  100 
 
 		 368 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  65.31 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  61.29 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  53.56 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 347 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  50.91 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.62 
 
 		 176 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  35.52 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.43 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.26 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  50 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  40.13 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.08 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  48.18 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  45.87 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 306 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  53.33 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 162 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.87 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35.95 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.31 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1612  NLP/P60  59.21 
 
 		 200 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 204 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.1 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.83 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  50.53 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 271 aa  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  47.67 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.44 
 
 		 531 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.11 
 
 		 222 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1243  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 169 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  36.02 
 
 		 278 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  41.23 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.16 
 
 		 1048 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 327 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 501 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 327 aa  86.3  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.55 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  37.69 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.69 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  37.34 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  41.91 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.23 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.82 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.62 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  46.15 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.35 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.28 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.93 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  38.57 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.83 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>