More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8103 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  100 
 
 
393 aa  797    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  93.94 
 
 
416 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  49.52 
 
 
417 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  38.97 
 
 
859 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.43 
 
 
340 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  47.11 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.21 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  46.56 
 
 
348 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  45.87 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  46.56 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
446 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  47.11 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  47.11 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  45.97 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.81 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  45.8 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45 
 
 
162 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  44.95 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
394 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.13 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.22 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.54 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  44.72 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  45.04 
 
 
348 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  44.95 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 
291 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.19 
 
 
438 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
335 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.34 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.83 
 
 
342 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.24 
 
 
487 aa  89.4  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  48.08 
 
 
308 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  43.97 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  43.97 
 
 
432 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  43.27 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.95 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.22 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.81 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.44 
 
 
176 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.62 
 
 
523 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44 
 
 
270 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.11 
 
 
235 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
363 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  47.57 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.44 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  41 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40 
 
 
1048 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  28.43 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  44.55 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  42.37 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  47.32 
 
 
327 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.09 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  46.39 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  42.71 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  41.58 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  39.82 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  47.42 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  40.62 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  40 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  40.62 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  40.62 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  43.75 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  42.39 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  37.39 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  46.32 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.24 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.35 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  40.57 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  41.35 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.05 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  42.39 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>