More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3124 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  100 
 
 
327 aa  658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  36.47 
 
 
350 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.23 
 
 
340 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.64 
 
 
321 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.13 
 
 
337 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  33.11 
 
 
306 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.62 
 
 
342 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  32.85 
 
 
348 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  33.11 
 
 
319 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  35.21 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  33.44 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  30.47 
 
 
331 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  33.78 
 
 
315 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  32.19 
 
 
323 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
333 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  34.58 
 
 
394 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  32.53 
 
 
333 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.21 
 
 
330 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  29.79 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  30.7 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  35.02 
 
 
348 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  32.9 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.75 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  30.87 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  30.05 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  32.32 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  62.37 
 
 
380 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  29.59 
 
 
372 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  29.59 
 
 
372 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  54.39 
 
 
335 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  29.29 
 
 
372 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  29.39 
 
 
323 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  29.94 
 
 
373 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  34.07 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  48.72 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  52.07 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  29.13 
 
 
375 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  50 
 
 
160 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  48.33 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  52.21 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  28.44 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  53.92 
 
 
350 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  27.61 
 
 
348 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  28.33 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  51.52 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  52.68 
 
 
393 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.34 
 
 
531 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  50 
 
 
437 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  49.54 
 
 
363 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.33 
 
 
222 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  29.66 
 
 
363 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
349 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  30.91 
 
 
432 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  48.11 
 
 
361 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  48.11 
 
 
361 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45 
 
 
162 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
453 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  47.11 
 
 
476 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.88 
 
 
432 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  42.14 
 
 
388 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
452 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.55 
 
 
438 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
236 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.74 
 
 
475 aa  99.4  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
432 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  50.47 
 
 
398 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
556 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
391 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  47.86 
 
 
556 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.86 
 
 
393 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.08 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  50.53 
 
 
625 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  48.08 
 
 
217 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  46.9 
 
 
281 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
502 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.53 
 
 
235 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  36.8 
 
 
859 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  41.79 
 
 
536 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.97 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
491 aa  92.4  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  48.11 
 
 
232 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  35.35 
 
 
388 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.19 
 
 
523 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  38.04 
 
 
501 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.91 
 
 
368 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
392 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.34 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  41.84 
 
 
208 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
374 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>