More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3648 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  100 
 
 
391 aa  784    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  34.3 
 
 
556 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  35.79 
 
 
536 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  34.31 
 
 
532 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  35.2 
 
 
532 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  31.8 
 
 
424 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  53.78 
 
 
265 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  30.27 
 
 
575 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.47 
 
 
370 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  29.9 
 
 
430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  30 
 
 
582 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.97 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  29.69 
 
 
420 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.93 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  29.21 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  29.53 
 
 
577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  29.28 
 
 
582 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.35 
 
 
420 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  29.35 
 
 
420 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  29.04 
 
 
579 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  29.35 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  29.35 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  28.81 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  29.63 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.88 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  28.67 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  28.76 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.81 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.63 
 
 
580 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  48.09 
 
 
217 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.97 
 
 
216 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.9 
 
 
432 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  39.19 
 
 
150 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  35.86 
 
 
232 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  35.97 
 
 
245 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  27.94 
 
 
598 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
150 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  44.35 
 
 
458 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  45.97 
 
 
183 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  45.16 
 
 
258 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.22 
 
 
1048 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  47.41 
 
 
454 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
365 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.97 
 
 
248 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
450 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  43.97 
 
 
365 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0234  hypothetical protein  45.61 
 
 
403 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  49.57 
 
 
208 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  46.96 
 
 
283 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  46.96 
 
 
283 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  27.51 
 
 
298 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  46.96 
 
 
283 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
476 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
220 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
269 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  45.61 
 
 
436 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  45.61 
 
 
436 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  40.31 
 
 
295 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  45.61 
 
 
436 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.73 
 
 
198 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  26.37 
 
 
319 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
273 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.73 
 
 
177 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 
318 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40 
 
 
257 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
269 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  47.46 
 
 
274 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  42.61 
 
 
205 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
417 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
409 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
255 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  44.25 
 
 
275 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
223 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
223 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.82 
 
 
202 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
192 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.16 
 
 
224 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  42.98 
 
 
476 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  44.25 
 
 
271 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
273 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
273 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
273 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
273 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
273 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
249 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  38.57 
 
 
208 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
192 aa  99.4  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 
181 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
223 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  29.8 
 
 
235 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.79 
 
 
234 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.41 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
556 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>