More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2976 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  100 
 
 		 523 aa  990    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  49.13 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 556 aa  119  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.37 
 
 		 391 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 265 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.69 
 
 		 300 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.69 
 
 		 1048 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 256 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  44.35 
 
 		 257 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 556 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  49.57 
 
 		 370 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 536 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 417 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 340 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 259 aa  94.7  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 233 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 216 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 224 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.06 
 
 		 393 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  44.07 
 
 		 273 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  48.11 
 
 		 487 aa  92.8  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.01 
 
 		 224 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 223 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.01 
 
 		 223 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 232 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 257 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 394 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.72 
 
 		 255 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.28 
 
 		 318 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 223 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.41 
 
 		 223 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 388 aa  90.1  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 223 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 345 aa  89.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 298 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 532 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  41.73 
 
 		 208 aa  89.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 183 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 297 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 532 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 325 aa  88.2  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 357 aa  87.4  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.11 
 
 		 217 aa  87  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.12 
 
 		 368 aa  87  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 191 aa  87  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.72 
 
 		 332 aa  86.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 248 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 168 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 150 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  40.65 
 
 		 173 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.49 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  26.97 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  38.57 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.23 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  46 
 
 		 411 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  32.12 
 
 		 205 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 235 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.45 
 
 		 176 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  34.56 
 
 		 625 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  41.6 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  37.29 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  40.34 
 
 		 133 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  40 
 
 		 249 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  31.14 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  31.33 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.22 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  44.44 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  37.21 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  33.6 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>