More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4384 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  100 
 
 
556 aa  1129    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  41.24 
 
 
536 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
532 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  42.66 
 
 
532 aa  343  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  34.3 
 
 
391 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  25.12 
 
 
424 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  27.54 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  27.88 
 
 
420 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.88 
 
 
420 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  27.88 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  27.88 
 
 
420 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  27.88 
 
 
420 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.85 
 
 
426 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  26.85 
 
 
426 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.34 
 
 
413 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.07 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  25.76 
 
 
430 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  25.26 
 
 
575 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  28.77 
 
 
298 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.59 
 
 
370 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  34.07 
 
 
232 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.55 
 
 
391 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
255 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 
751 aa  101  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 
616 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
242 aa  98.6  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.04 
 
 
224 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
216 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  27.83 
 
 
319 aa  98.2  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  24.16 
 
 
582 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
296 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45 
 
 
265 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.04 
 
 
223 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  29.13 
 
 
295 aa  97.1  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  23.71 
 
 
582 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.04 
 
 
223 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  38.04 
 
 
224 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.04 
 
 
223 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  30.32 
 
 
235 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  41.01 
 
 
440 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
476 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  44 
 
 
217 aa  94  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  24.68 
 
 
577 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  36.2 
 
 
223 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  36.54 
 
 
223 aa  94  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.1 
 
 
335 aa  94  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.17 
 
 
523 aa  93.6  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
232 aa  93.6  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  33.94 
 
 
230 aa  93.2  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  41.01 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  23.85 
 
 
578 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  38.26 
 
 
188 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
188 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  47.79 
 
 
327 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
257 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.88 
 
 
278 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  41.01 
 
 
485 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
306 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
345 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
365 aa  90.5  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  40.52 
 
 
365 aa  90.5  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  42.74 
 
 
257 aa  90.5  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
177 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  39.2 
 
 
177 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  23.58 
 
 
582 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  42.86 
 
 
1048 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
177 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  23.32 
 
 
579 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  35.06 
 
 
269 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  41.18 
 
 
513 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  40.77 
 
 
370 aa  89  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  41.6 
 
 
197 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  46.96 
 
 
174 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.26 
 
 
234 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  41.32 
 
 
208 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  39.2 
 
 
198 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  30.88 
 
 
269 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  43.44 
 
 
177 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0234  hypothetical protein  41.03 
 
 
403 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
150 aa  87.8  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.4 
 
 
181 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  46.09 
 
 
380 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  41.6 
 
 
177 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
183 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  39.68 
 
 
181 aa  87  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  42.4 
 
 
181 aa  87  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.84 
 
 
333 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.93 
 
 
218 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.93 
 
 
218 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.93 
 
 
218 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.93 
 
 
218 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  37.93 
 
 
234 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.32 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  37.93 
 
 
234 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  37.93 
 
 
234 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  39.72 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
177 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  41.53 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  34.06 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>