More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1268 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  100 
 
 		 177 aa  361  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  98.31 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  97.18 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  91.53 
 
 		 177 aa  316  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  71.91 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  69.66 
 
 		 181 aa  238  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  73.21 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  71.84 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  68.26 
 
 		 173 aa  224  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  80.62 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  70.19 
 
 		 174 aa  220  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  57.14 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  51.88 
 
 		 209 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  45.05 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  50.92 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  47.8 
 
 		 248 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  57.66 
 
 		 133 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  47.54 
 
 		 258 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  56.72 
 
 		 212 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  43.08 
 
 		 205 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  48.55 
 
 		 364 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  44.09 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  54.35 
 
 		 249 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  58.06 
 
 		 382 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  57.38 
 
 		 418 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  48.26 
 
 		 353 aa  151  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  57.38 
 
 		 404 aa  151  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  48.26 
 
 		 354 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  47.98 
 
 		 363 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  47.98 
 
 		 363 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  56.59 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  47.98 
 
 		 363 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  49.7 
 
 		 407 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  49.7 
 
 		 407 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  48.31 
 
 		 407 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  49.7 
 
 		 407 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  49.7 
 
 		 407 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  49.7 
 
 		 404 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  49.7 
 
 		 404 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  56.45 
 
 		 369 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  50.3 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  57.38 
 
 		 407 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  50.75 
 
 		 214 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  49.7 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  56.8 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  50.75 
 
 		 212 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  51.59 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  48.48 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  52.42 
 
 		 242 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  52.76 
 
 		 226 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  48.5 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  55.74 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  51.61 
 
 		 242 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  46.36 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  46.36 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  50 
 
 		 224 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  44.22 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  50 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  49.21 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  49.21 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  49.21 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  48.41 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  49.21 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  53.33 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  49.21 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  49.21 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  49.21 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  48.41 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  51.37 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.33 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  48.78 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  49.59 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 223 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  46.83 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  46.15 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  46.15 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  44.63 
 
 		 283 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 279 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 283 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  44.63 
 
 		 283 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  49.59 
 
 		 287 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.33 
 
 		 226 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 215 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 215 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  45.61 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 271 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  48.41 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  45.61 
 
 		 271 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  45.61 
 
 		 271 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  45.61 
 
 		 271 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>