More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0741 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  60.61 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  60 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  58.17 
 
 		 190 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  59.46 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  62.99 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  46.67 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  50 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  47.88 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  54.62 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  55.4 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  58.2 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  58.4 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  58.2 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  53.28 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  44.58 
 
 		 258 aa  134  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  54.92 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  55.46 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  54.92 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  39.88 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  46.85 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  50.74 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  39.29 
 
 		 209 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  52.1 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  52.1 
 
 		 226 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  42.77 
 
 		 404 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  51.26 
 
 		 382 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 404 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 407 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  52.1 
 
 		 404 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  51.26 
 
 		 418 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  49.62 
 
 		 133 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 224 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  39.35 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  39.88 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.44 
 
 		 223 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 224 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  42.94 
 
 		 369 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 234 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 223 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.62 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.62 
 
 		 218 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 223 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 234 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 218 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 218 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.62 
 
 		 218 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  42.69 
 
 		 363 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  42.69 
 
 		 363 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  42.69 
 
 		 363 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  39.04 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  38.51 
 
 		 228 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  50.42 
 
 		 364 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 354 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  38.19 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  42.35 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  38.19 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  39.46 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  38.3 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  36.51 
 
 		 205 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 283 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  45.54 
 
 		 283 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  45.54 
 
 		 283 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  41.13 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.16 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.8 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  36.88 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 279 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 273 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  44.35 
 
 		 287 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  40 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 214 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 214 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 208 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  36.61 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  43.09 
 
 		 205 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 208 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  37.19 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 207 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>