More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6213 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  100 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  100 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  97.52 
 
 		 363 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  86.3 
 
 		 364 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  74.47 
 
 		 369 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  77.96 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  76.92 
 
 		 354 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  52.96 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  82.56 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  82.05 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  80.93 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  55.38 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  51.06 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  68.22 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  68.22 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  68.22 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  68.22 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  68.51 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  59.17 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  59.09 
 
 		 258 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  67.88 
 
 		 226 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  59.38 
 
 		 249 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  68.75 
 
 		 212 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  63.49 
 
 		 177 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  47.73 
 
 		 173 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  52.94 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  57.26 
 
 		 177 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  52.94 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  52.94 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  51.66 
 
 		 179 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  57.26 
 
 		 177 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  57.26 
 
 		 177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  52.94 
 
 		 218 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  45.65 
 
 		 181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  52.94 
 
 		 234 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  52.94 
 
 		 218 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  46.47 
 
 		 160 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  52.94 
 
 		 218 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  52.94 
 
 		 218 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.57 
 
 		 223 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.57 
 
 		 223 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.64 
 
 		 224 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.64 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  56.56 
 
 		 177 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  51.26 
 
 		 221 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.64 
 
 		 223 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.64 
 
 		 223 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  51.26 
 
 		 224 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  51.26 
 
 		 221 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  50.42 
 
 		 223 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  45.11 
 
 		 183 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  45.24 
 
 		 209 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 215 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 209 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  51.97 
 
 		 181 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  44.06 
 
 		 215 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  51.88 
 
 		 174 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  49.18 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  49.18 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  43.86 
 
 		 178 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.9 
 
 		 226 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  45.83 
 
 		 169 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  48.74 
 
 		 222 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  45.6 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  51.52 
 
 		 177 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  53.28 
 
 		 197 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  45.83 
 
 		 170 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 211 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 207 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  47.01 
 
 		 166 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.78 
 
 		 170 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 188 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  47.97 
 
 		 188 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  49.15 
 
 		 205 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 194 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  45.6 
 
 		 187 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 220 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  45.08 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  45 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 192 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 202 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  51.24 
 
 		 133 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  45.45 
 
 		 226 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  46.77 
 
 		 198 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  46.77 
 
 		 177 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 192 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  50.81 
 
 		 190 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  39.51 
 
 		 225 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 214 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 194 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 215 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  44.19 
 
 		 201 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  49.56 
 
 		 181 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  49.15 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  52.54 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 188 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>