More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2519 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  100 
 
 		 225 aa  456  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  67.68 
 
 		 242 aa  232  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  56.11 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  46.54 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  58.67 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  46.77 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  58.67 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  55.06 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  54.49 
 
 		 201 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  46.86 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  46.59 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  52.03 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  47.56 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  53.44 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  51.8 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  51.08 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  52.63 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  52.63 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  52.63 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  52.63 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  52.63 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  52.63 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  52.63 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 183 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  52.63 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  55.83 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  47.34 
 
 		 170 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  55 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  55 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  54.17 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  55 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  51.52 
 
 		 169 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  54.1 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  47.89 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  43.36 
 
 		 404 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  50 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  49.17 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 365 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 365 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.84 
 
 		 170 aa  121  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 369 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  39.51 
 
 		 363 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  39.51 
 
 		 363 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  45 
 
 		 418 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  39.51 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  44.19 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  47.5 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  38.61 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  42.03 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 407 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 404 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 407 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 407 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 407 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 404 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 407 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  43.55 
 
 		 407 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 353 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  42.64 
 
 		 181 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  43.51 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.85 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.06 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  38.46 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.25 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  46.28 
 
 		 476 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  36.68 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 179 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  45.45 
 
 		 173 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  38.83 
 
 		 193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  46.88 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.33 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  41.67 
 
 		 166 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  45.04 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  42.86 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  46.28 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  38.57 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  38.57 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  38.57 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>