More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2789 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  46.05 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  46.05 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 265 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.21 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  38.6 
 
 		 258 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  52.54 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  51.52 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.14 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  43.62 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  49.56 
 
 		 369 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  43.62 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  43.62 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  46.27 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.27 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.27 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  49.56 
 
 		 382 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  43.62 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  43.62 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  43.62 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  43.62 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  43.62 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  50 
 
 		 365 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  39.66 
 
 		 404 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  39.88 
 
 		 418 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  50 
 
 		 365 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  49.56 
 
 		 353 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 363 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40.23 
 
 		 363 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  49.56 
 
 		 354 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 363 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  37.93 
 
 		 364 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  43.38 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.65 
 
 		 370 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 407 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  43.38 
 
 		 221 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  51.72 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 407 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  43.29 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  46.61 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  53.57 
 
 		 349 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  49.56 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.32 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.36 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  45.74 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  44.36 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  41.25 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.57 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  44.35 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  43.29 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  48.36 
 
 		 476 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 249 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 454 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  43.55 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.25 
 
 		 211 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 536 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.85 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.58 
 
 		 333 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  44.09 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.22 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.87 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  35.98 
 
 		 458 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  50.86 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 424 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  40.13 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  44.03 
 
 		 274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  39.24 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  46.92 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  43.2 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 208 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 450 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  40.85 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  50.47 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  45 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  44.8 
 
 		 532 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  46.46 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  43.59 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  45.8 
 
 		 341 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 246 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>