More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0479 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  100 
 
 
225 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  89.38 
 
 
226 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  60.44 
 
 
205 aa  284  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  56.77 
 
 
208 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  56 
 
 
208 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  55.9 
 
 
207 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  53.43 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  45.56 
 
 
198 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  54.41 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  51.8 
 
 
188 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.41 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.41 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.4 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.4 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.4 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  49.26 
 
 
209 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  49.26 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.13 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.96 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.96 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.96 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.77 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.96 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.96 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.96 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.96 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.67 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  48.39 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  47.58 
 
 
249 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
221 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  49.18 
 
 
179 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  49.57 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  46.77 
 
 
234 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  48.44 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  45.8 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  32.79 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  46.77 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  35.14 
 
 
283 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  46.77 
 
 
249 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  45.8 
 
 
177 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  35.14 
 
 
283 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  46.77 
 
 
269 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  46.77 
 
 
249 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
177 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  35.33 
 
 
283 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  41.18 
 
 
169 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  45.67 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  49.17 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  44.68 
 
 
181 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  44.68 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  41.1 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  45.45 
 
 
178 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  43.54 
 
 
248 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  42.15 
 
 
275 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
230 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  42.15 
 
 
271 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  42.55 
 
 
215 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  45.69 
 
 
404 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  44.12 
 
 
226 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  47.11 
 
 
197 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  47.11 
 
 
177 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
363 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  45.83 
 
 
364 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  45.45 
 
 
363 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
363 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  44.36 
 
 
215 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
418 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  42.18 
 
 
249 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
234 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45.97 
 
 
205 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
177 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  48.28 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  43.61 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
382 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  45 
 
 
354 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  40.94 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  37.67 
 
 
273 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  37.67 
 
 
273 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  37.67 
 
 
273 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  37.67 
 
 
273 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
192 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  37.67 
 
 
273 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.16 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
353 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  49.17 
 
 
133 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.04 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>