More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0223 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  100 
 
 		 249 aa  520  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  89.96 
 
 		 257 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  97.79 
 
 		 249 aa  460  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  97.79 
 
 		 249 aa  460  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  93.56 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  96.9 
 
 		 269 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  96.46 
 
 		 269 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  96.02 
 
 		 249 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  98.08 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  49.69 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  49.06 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  49.06 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  50 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 283 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  54.26 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  50 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  49.25 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  49.25 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  49.25 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  49.25 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  49.25 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  51.56 
 
 		 356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  45.67 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  32.79 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  46.77 
 
 		 226 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.7 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  44.74 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.55 
 
 		 205 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  38.31 
 
 		 179 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 188 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.98 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 177 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  36.23 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  42.15 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  36.76 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  35.75 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  35.75 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  35.75 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  35.75 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  35.75 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  35.75 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  35.75 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  42.24 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  41.27 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  42.24 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  35.07 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  35.07 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  43.1 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  38.89 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  30.13 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 192 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.23 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 202 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  37.1 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  34.85 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  34.65 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 382 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  37.4 
 
 		 404 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 363 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  35.43 
 
 		 407 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  36.15 
 
 		 363 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  36.15 
 
 		 363 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 210 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>