More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1679 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  60.32 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  50 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  49.6 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  49.6 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  47.37 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.49 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.49 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.21 
 
 		 476 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  45.61 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  50 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 349 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  46.77 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  47.93 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  47.46 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  47.46 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  45.61 
 
 		 458 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  46.61 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  39.35 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  44.7 
 
 		 325 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 307 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  44 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.28 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  38.96 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  38.71 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  38.71 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  45 
 
 		 150 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.43 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  40.34 
 
 		 205 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.83 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  38.24 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  40.87 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.97 
 
 		 273 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  34.43 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  42.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  42.98 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  33.17 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  33.52 
 
 		 356 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  36.05 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  40.35 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 424 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 333 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  43.59 
 
 		 273 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.92 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  36.88 
 
 		 283 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 556 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  44.17 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  44.54 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  39.1 
 
 		 342 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.94 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.61 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>