More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1747 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  67.42 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  67.05 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  67.23 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  80.3 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  69.81 
 
 		 177 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  64.44 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  64.77 
 
 		 173 aa  214  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  68.36 
 
 		 177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  72.34 
 
 		 197 aa  210  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  67.8 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  54.19 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  46.43 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  50.62 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  160  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  46.2 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  47.51 
 
 		 258 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  55.88 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  49.72 
 
 		 248 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  43.01 
 
 		 205 aa  147  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  57.6 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  53.29 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  58.73 
 
 		 177 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  59.69 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  57.6 
 
 		 226 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  50 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 214 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  52.53 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  51.9 
 
 		 160 aa  141  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 234 aa  140  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  55.2 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  43.85 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 407 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 404 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 		 404 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  51.88 
 
 		 404 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  52.38 
 
 		 226 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 369 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  45.86 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  45.86 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  52.67 
 
 		 382 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  53.12 
 
 		 234 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  53.12 
 
 		 234 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 418 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  53.12 
 
 		 234 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  53.12 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  47.65 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 283 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  53.12 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  53.12 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  53.12 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  39.86 
 
 		 283 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  43.41 
 
 		 363 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 363 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  39.86 
 
 		 283 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 363 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  36.47 
 
 		 283 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  42.86 
 
 		 364 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  52.34 
 
 		 234 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  49.59 
 
 		 242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  49.59 
 
 		 242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  38.82 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  61.95 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 224 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  52.38 
 
 		 223 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 354 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  52.38 
 
 		 223 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  52.38 
 
 		 223 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 353 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  50.79 
 
 		 224 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  41.24 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  50 
 
 		 223 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 275 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  50 
 
 		 223 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  50 
 
 		 223 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  40.3 
 
 		 271 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  48.78 
 
 		 221 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 256 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  36.99 
 
 		 273 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  36.99 
 
 		 273 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.99 
 
 		 273 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.99 
 
 		 273 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>