More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2291 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  100 
 
 		 242 aa  486  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  66.47 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  56.6 
 
 		 187 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  56.03 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  49.21 
 
 		 194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  60.77 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  54.78 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  56.33 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  62.5 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  57.78 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.45 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.45 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.45 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.45 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.45 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.45 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.45 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.78 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  52.48 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  48.48 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  52.48 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.78 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.78 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  58.2 
 
 		 221 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  54.07 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  51.41 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  54.55 
 
 		 183 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  51.54 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  51.15 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  49.62 
 
 		 169 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  47.1 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  42.62 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  52.63 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  49.17 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  48.41 
 
 		 170 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  45 
 
 		 404 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.05 
 
 		 365 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  42.54 
 
 		 369 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 365 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  45 
 
 		 418 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  39.6 
 
 		 407 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 382 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  47.5 
 
 		 212 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  39.02 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  41.73 
 
 		 363 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 363 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  45 
 
 		 407 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  45 
 
 		 407 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  45 
 
 		 407 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  40.54 
 
 		 404 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  40.54 
 
 		 407 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  45 
 
 		 404 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  45 
 
 		 407 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 363 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  42.25 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  41.86 
 
 		 181 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  37.09 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  40.29 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 354 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  40 
 
 		 181 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  41.3 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 353 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  35.78 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  41.3 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  41.3 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.13 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  50 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 174 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  44.93 
 
 		 168 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.9 
 
 		 173 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  40.6 
 
 		 273 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  40.6 
 
 		 273 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  40.6 
 
 		 273 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  40.6 
 
 		 273 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  40.6 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  38.2 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  35.14 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  38.2 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  41.09 
 
 		 178 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>