More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0435 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  67.22 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.86 
 
 		 391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  34.07 
 
 		 556 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  35.81 
 
 		 532 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  35.81 
 
 		 532 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 257 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  29.95 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  53.47 
 
 		 382 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 333 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 365 aa  98.2  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  40 
 
 		 365 aa  98.2  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 418 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.32 
 
 		 413 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  42.52 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  32.39 
 
 		 536 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.6 
 
 		 424 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 183 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 307 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 319 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  34.78 
 
 		 420 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  34.78 
 
 		 420 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  34.78 
 
 		 420 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.42 
 
 		 217 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 269 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  34.3 
 
 		 420 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39.13 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  34.3 
 
 		 420 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  33.8 
 
 		 333 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  34.56 
 
 		 426 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  34.56 
 
 		 426 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 298 aa  88.6  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  37.78 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 338 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  38.21 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 556 aa  88.2  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 150 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  36.24 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  36.67 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  36.24 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.63 
 
 		 432 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 450 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.24 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  36.24 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  27.07 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  40 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 341 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  36.67 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  31.92 
 
 		 430 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  35.57 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  35.04 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  29.56 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.26 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  34.68 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  37.61 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  32.32 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  40.19 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  35.38 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  38.39 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  34.01 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  37.39 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  37.39 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  38.53 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  37.39 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.39 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  37.39 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.39 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.39 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.39 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  33.09 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  32.27 
 
 		 575 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  28.22 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  39.06 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 341 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  33.33 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.07 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>