More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0577 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  67.22 
 
 
232 aa  298  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
265 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.12 
 
 
370 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
476 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  42.96 
 
 
208 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
274 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  34.17 
 
 
532 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
210 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
183 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
391 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.75 
 
 
307 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  36.18 
 
 
365 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  36.18 
 
 
365 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  34.12 
 
 
418 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  32.63 
 
 
391 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  34.17 
 
 
532 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  36.2 
 
 
284 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  30.97 
 
 
556 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  36.11 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  37.69 
 
 
278 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
556 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  40.87 
 
 
458 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  29.76 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.17 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
349 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.37 
 
 
319 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  42.86 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.41 
 
 
150 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  44 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  30.86 
 
 
536 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  30.92 
 
 
424 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36.6 
 
 
341 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  36.64 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
188 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.73 
 
 
413 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.14 
 
 
341 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  31.25 
 
 
420 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.93 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 
420 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  35.43 
 
 
333 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  38.76 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.91 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  40.32 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  30.77 
 
 
420 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  34.39 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  30.77 
 
 
420 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.62 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  37.88 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
240 aa  89  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  30.77 
 
 
420 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.14 
 
 
342 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  40.17 
 
 
170 aa  88.6  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  38.84 
 
 
333 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  38.51 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.64 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  30.73 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
150 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  34.46 
 
 
188 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  36 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  39.13 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  34.46 
 
 
188 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  36.5 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.13 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  37.59 
 
 
335 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  33.49 
 
 
430 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  27.06 
 
 
549 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
235 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.1 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  33.33 
 
 
169 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  37.6 
 
 
192 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.13 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  38.79 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
347 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
342 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  34.93 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  38.26 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.13 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  32.09 
 
 
575 aa  85.1  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  40.57 
 
 
174 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
211 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>