More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4127 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  90.04 
 
 		 532 aa  909    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  100 
 
 		 532 aa  1066    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  53.04 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.86 
 
 		 391 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 424 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.27 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.91 
 
 		 420 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  25.91 
 
 		 420 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  25.91 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  25.91 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  25.91 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 235 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  25.32 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.71 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  25 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.65 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  25.13 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  51.28 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  26.28 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.21 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 216 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  47.9 
 
 		 255 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.93 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 298 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.84 
 
 		 224 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  44.52 
 
 		 223 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  44.52 
 
 		 223 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  44.52 
 
 		 223 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.84 
 
 		 223 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  43.84 
 
 		 223 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  41.89 
 
 		 222 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 265 aa  107  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.82 
 
 		 1048 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  27.08 
 
 		 296 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  43.26 
 
 		 215 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  45.76 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  25 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  35.81 
 
 		 232 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  25.32 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  24.82 
 
 		 582 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  44.96 
 
 		 181 aa  103  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 215 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  26.72 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 150 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  25.55 
 
 		 582 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  42.03 
 
 		 234 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.94 
 
 		 580 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 183 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 150 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.36 
 
 		 205 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  41.01 
 
 		 218 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 333 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  41.01 
 
 		 218 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  41.01 
 
 		 218 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  41.01 
 
 		 218 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.28 
 
 		 210 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  41.3 
 
 		 234 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  41.3 
 
 		 234 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  41.3 
 
 		 234 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 207 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.44 
 
 		 173 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  46.09 
 
 		 188 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 188 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 616 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  40.87 
 
 		 242 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 242 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  41.79 
 
 		 228 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 192 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  41.67 
 
 		 226 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  43.8 
 
 		 257 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  45.07 
 
 		 168 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  46.28 
 
 		 202 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 192 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.08 
 
 		 177 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.24 
 
 		 217 aa  98.2  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.08 
 
 		 198 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 223 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 295 aa  97.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40.58 
 
 		 221 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 221 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  23.33 
 
 		 598 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  46.4 
 
 		 170 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  39.86 
 
 		 226 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 188 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 242 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  44.19 
 
 		 177 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.18 
 
 		 269 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  44.19 
 
 		 197 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  38.01 
 
 		 181 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  44.93 
 
 		 208 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 208 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  44.17 
 
 		 201 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 220 aa  94.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>