More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0724 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  100 
 
 		 419 aa  855    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  30.26 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  43.94 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  41.54 
 
 		 267 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 269 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 307 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 269 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 284 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  43.93 
 
 		 266 aa  96.3  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.06 
 
 		 424 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 242 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  36.3 
 
 		 291 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 536 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  45.92 
 
 		 226 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 257 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 188 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  44.9 
 
 		 225 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  25.62 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  33.55 
 
 		 205 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 234 aa  86.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  31.98 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.64 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.57 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  38.21 
 
 		 181 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  42.37 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  48.96 
 
 		 133 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 177 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  42.37 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  42.98 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  39.5 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.44 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.42 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  45.13 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  48.91 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  34.01 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  40 
 
 		 197 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 246 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  40 
 
 		 177 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 202 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.72 
 
 		 208 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  39.83 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  39.83 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  39.83 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.43 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  40.98 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  43.69 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  39.83 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  27.89 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  39.83 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  39.83 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  40 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  40.5 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  32.76 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  38.98 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  27.51 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  27.51 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  38.13 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  35.94 
 
 		 170 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  29.71 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 150 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  30.22 
 
 		 205 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.42 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  39.68 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  38.4 
 
 		 178 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  38.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  34.71 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>