More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12218 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  58.79 
 
 
372 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  58.79 
 
 
372 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  58.29 
 
 
372 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  58.12 
 
 
378 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  58.25 
 
 
378 aa  358  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  58.24 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  59.54 
 
 
348 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  56.07 
 
 
370 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  58.97 
 
 
348 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  59.26 
 
 
348 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  57.55 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  53.87 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  50 
 
 
361 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  50 
 
 
361 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  51.85 
 
 
363 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.08 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  35.77 
 
 
347 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  30.43 
 
 
343 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.81 
 
 
340 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  28.61 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.98 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  49.63 
 
 
232 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  48.95 
 
 
370 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  32.79 
 
 
446 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  31.14 
 
 
327 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  46.19 
 
 
365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  46.19 
 
 
365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  52.34 
 
 
350 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50.96 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
227 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  48.56 
 
 
365 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  47.11 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  53.54 
 
 
164 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  29.64 
 
 
366 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
173 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  26.32 
 
 
334 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.88 
 
 
321 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  50 
 
 
342 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  49.02 
 
 
380 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  27.41 
 
 
306 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
323 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.7 
 
 
391 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
333 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.81 
 
 
331 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.76 
 
 
388 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.33 
 
 
235 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  45.65 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  47.47 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.12 
 
 
349 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
162 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40 
 
 
285 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
224 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.9 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.23 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.86 
 
 
217 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  42.57 
 
 
459 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  45.13 
 
 
221 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
417 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
317 aa  94  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
224 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
221 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.46 
 
 
223 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
223 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
223 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.46 
 
 
234 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
223 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
223 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
223 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
218 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
218 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
218 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.65 
 
 
218 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  40 
 
 
257 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
234 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
234 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  43.69 
 
 
524 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.65 
 
 
234 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  42.39 
 
 
333 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
325 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.48 
 
 
371 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45.45 
 
 
205 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 
291 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.95 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41 
 
 
293 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.59 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  34.33 
 
 
859 aa  88.6  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.6 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  36 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
535 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.19 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  39.23 
 
 
210 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
476 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.07 
 
 
265 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  26.5 
 
 
469 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45 
 
 
531 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.83 
 
 
222 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>