More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0917 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.95 
 
 		 372 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 372 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 378 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 372 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 347 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  48.18 
 
 		 393 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 378 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 348 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 348 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40 
 
 		 366 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 348 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 363 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 348 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 370 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 363 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 363 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 343 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.95 
 
 		 332 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  42.2 
 
 		 361 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 361 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 330 aa  97.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.39 
 
 		 438 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.67 
 
 		 331 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 446 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  52.81 
 
 		 319 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 432 aa  90.9  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 350 aa  90.5  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 335 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 333 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 350 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 452 aa  88.6  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 232 aa  88.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  50 
 
 		 334 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.38 
 
 		 235 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 257 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.27 
 
 		 321 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 232 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.86 
 
 		 370 aa  86.7  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  46.59 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 417 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.35 
 
 		 368 aa  85.1  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 317 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 329 aa  84.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.56 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 380 aa  82.4  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  42.53 
 
 		 459 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  48.1 
 
 		 281 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  46.59 
 
 		 400 aa  80.9  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  47.56 
 
 		 345 aa  80.9  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  44.32 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.36 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.36 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  39 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.94 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  44.07 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  35.37 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 495 aa  78.6  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  40.95 
 
 		 333 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 535 aa  78.2  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 388 aa  77.8  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  33.09 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.42 
 
 		 388 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  40.19 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 269 aa  77.4  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 480 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  35.15 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 392 aa  77.4  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  31.58 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  34.55 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  31.58 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  31.58 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40 
 
 		 453 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  42.27 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.23 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  44.05 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  32.73 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>