61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0505 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  74.05 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  70.22 
 
 
365 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  70.22 
 
 
365 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  70.22 
 
 
365 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  70 
 
 
201 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  70 
 
 
199 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  70 
 
 
201 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  53.12 
 
 
234 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  53.55 
 
 
232 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  58.62 
 
 
220 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
378 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  48.29 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  46.37 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.97 
 
 
372 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.97 
 
 
372 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  55.47 
 
 
216 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  44.39 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  48.55 
 
 
370 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  53.72 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  53.72 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  53.72 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  52.03 
 
 
220 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  48.88 
 
 
348 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  55.56 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  52.5 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  49.04 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  46.24 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  46.24 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  50.42 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  50.42 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  45.6 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  48.76 
 
 
363 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.55 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  43.7 
 
 
682 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  43.1 
 
 
171 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  43.1 
 
 
171 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  35.96 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  23.45 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  31.36 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  31.9 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  30.89 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  25.48 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  30.17 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  36.63 
 
 
324 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.32 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  31.9 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  23.4 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  37 
 
 
1048 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  24.51 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 
767 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  29.59 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  37.04 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  36.56 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  30.58 
 
 
227 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  26.67 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  28.46 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  31.65 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>