More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0023 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  100 
 
 		 164 aa  320  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  61.39 
 
 		 232 aa  137  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  48.46 
 
 		 348 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  49.23 
 
 		 363 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 348 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  50.42 
 
 		 348 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  53.21 
 
 		 348 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  56.57 
 
 		 363 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  53.64 
 
 		 370 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  46.73 
 
 		 227 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  55.21 
 
 		 361 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45 
 
 		 372 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  55.21 
 
 		 361 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45 
 
 		 372 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  55.56 
 
 		 363 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  53.54 
 
 		 393 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  44.29 
 
 		 372 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 347 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.93 
 
 		 281 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.45 
 
 		 432 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  44.63 
 
 		 432 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.64 
 
 		 235 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.08 
 
 		 332 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 317 aa  97.4  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 306 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  46 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 343 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  53.12 
 
 		 380 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 340 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 236 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 360 aa  91.3  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  41 
 
 		 323 aa  91.3  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 335 aa  90.9  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  48.48 
 
 		 350 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 446 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 298 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 204 aa  87.8  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.23 
 
 		 475 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  43 
 
 		 330 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.62 
 
 		 321 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.24 
 
 		 417 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  41.33 
 
 		 362 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 362 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  44.79 
 
 		 319 aa  84  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 452 aa  84  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  45.13 
 
 		 362 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 502 aa  84  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 362 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.94 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  45.88 
 
 		 400 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  35.44 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.22 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 323 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.02 
 
 		 438 aa  81.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 368 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 398 aa  81.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 337 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 342 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.7 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.83 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  36 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  35.56 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.35 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  35 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  28.67 
 
 		 476 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.82 
 
 		 393 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.95 
 
 		 372 aa  77.4  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 389 aa  77.4  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 359 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 368 aa  77.4  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 392 aa  77.4  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 333 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.18 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.68 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  40 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.32 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  39.18 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.79 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.85 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.74 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>