More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0883 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  50.58 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  46.18 
 
 		 259 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.79 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  52.34 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50.51 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 200 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.65 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 333 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  53.19 
 
 		 335 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  49.48 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  38.89 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  46.79 
 
 		 432 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  46.79 
 
 		 432 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  39.49 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 535 aa  95.5  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  48.91 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 524 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.01 
 
 		 476 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.86 
 
 		 556 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 378 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  42.02 
 
 		 370 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 378 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  53.47 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  42.48 
 
 		 372 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  40.57 
 
 		 393 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 372 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 338 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  45.63 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 348 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 372 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.31 
 
 		 331 aa  88.6  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 424 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  49.49 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  44.79 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.31 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 333 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  45.16 
 
 		 446 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  50.56 
 
 		 197 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.42 
 
 		 368 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 348 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.61 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 348 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.35 
 
 		 1048 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  48.98 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  38.02 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  46 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  47.25 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  42.57 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.14 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  43.53 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  43.53 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  40.8 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  50 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  37.01 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.67 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.11 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  40.38 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  41.76 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.56 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>