More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3237 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  100 
 
 		 380 aa  723    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  49.04 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.15 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  34.71 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  36.26 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.05 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  39.35 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  39.35 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  39.03 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  34.74 
 
 		 347 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.06 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  37.42 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  34.34 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  63.46 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  38.7 
 
 		 393 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  36.77 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.32 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  36.77 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  56.73 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  39.12 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  31.21 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.17 
 
 		 331 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  58.82 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  49.52 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  54.29 
 
 		 232 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  54.37 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.96 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  51.79 
 
 		 222 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  31.54 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.38 
 
 		 321 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.97 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.93 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  37.91 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  50 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  29.38 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  53.4 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  53.4 
 
 		 164 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  42.98 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  31.52 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 452 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 162 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  53.93 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  28.69 
 
 		 459 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  24.32 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  31.01 
 
 		 432 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  41.72 
 
 		 491 aa  96.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  44.29 
 
 		 317 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  51.61 
 
 		 227 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 502 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 236 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.25 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 453 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.3 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  27.43 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  50 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  54.44 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 160 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 859 aa  89  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 173 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 375 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 265 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.25 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  40 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  27.78 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.69 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.71 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.65 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  44 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  48.94 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  30.12 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  30.59 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  46.91 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>