More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3349 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  100 
 
 
372 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  100 
 
 
372 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  98.92 
 
 
372 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  70.45 
 
 
378 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  70.18 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  59.69 
 
 
393 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  58.03 
 
 
363 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  62.71 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  59.36 
 
 
348 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  58.48 
 
 
348 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  58.77 
 
 
348 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  59.06 
 
 
348 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  56.2 
 
 
363 aa  345  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  54.97 
 
 
363 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  53.12 
 
 
361 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  53.12 
 
 
361 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
348 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  39.35 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.35 
 
 
332 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  30.93 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.22 
 
 
340 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  29.82 
 
 
330 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  36.88 
 
 
446 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  33.83 
 
 
366 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  47.89 
 
 
232 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.86 
 
 
321 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  33.63 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  51.94 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  51.94 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  51.94 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  34.73 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  53.2 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  31.29 
 
 
327 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  50.89 
 
 
342 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  45.16 
 
 
364 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.73 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  48.62 
 
 
227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  32.22 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  29.54 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  51.49 
 
 
164 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  53.21 
 
 
380 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.47 
 
 
235 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
173 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
417 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  26.61 
 
 
337 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  28.23 
 
 
306 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  45.37 
 
 
331 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  31.33 
 
 
394 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  46 
 
 
333 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  30.51 
 
 
319 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.76 
 
 
459 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
333 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  26.48 
 
 
323 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  24.72 
 
 
334 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  27.38 
 
 
391 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.02 
 
 
222 aa  99.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  29.08 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
162 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.45 
 
 
281 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.12 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  43.36 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  43.36 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.62 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.45 
 
 
438 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.11 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
476 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.37 
 
 
217 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  46.23 
 
 
188 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.52 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
469 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
469 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
469 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
469 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.78 
 
 
452 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  51.19 
 
 
285 aa  92.8  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  39.16 
 
 
472 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
240 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40.38 
 
 
453 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
389 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
224 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.9 
 
 
531 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  36.62 
 
 
467 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.18 
 
 
224 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  46.07 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  38.13 
 
 
469 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.01 
 
 
265 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40 
 
 
223 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40 
 
 
223 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  44.79 
 
 
160 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  48.86 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>