More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5879 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  100 
 
 		 333 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  38.63 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  31.77 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  35.67 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.43 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  31.53 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  32.27 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.88 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.06 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.17 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  30.36 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.43 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  52.68 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  50 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.49 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  28.23 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  36.82 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  47.37 
 
 		 459 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  30.26 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  30.26 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  50 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.66 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  53.41 
 
 		 162 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  27.24 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 378 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  50 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  52.33 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 278 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.96 
 
 		 222 aa  99.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  47.22 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  47.22 
 
 		 269 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 350 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.86 
 
 		 531 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  44.54 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.96 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  53.06 
 
 		 180 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  43.08 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 284 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  27.69 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 160 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  26.91 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 432 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  48.8 
 
 		 231 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  39.73 
 
 		 388 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  46.23 
 
 		 217 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  52.29 
 
 		 190 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 375 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  40 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.93 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  40 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 452 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  40 
 
 		 363 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.75 
 
 		 235 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  48.39 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  43.52 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 491 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  39.45 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 230 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.19 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 556 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 517 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 348 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 210 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 502 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 199 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  46.85 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 501 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 374 aa  89.4  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  41.27 
 
 		 266 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.26 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  39.64 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.96 
 
 		 198 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.59 
 
 		 475 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>