More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1508 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  100 
 
 		 348 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  56.14 
 
 		 350 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  39.48 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  38.29 
 
 		 373 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  34.01 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.66 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  32.12 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  29.05 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  27.25 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  53.98 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  29.87 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  28.03 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  27.82 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  27.82 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  27.71 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  30.53 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  29.31 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  28.61 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  25.48 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  28.3 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  29.34 
 
 		 394 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  28.25 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  28.38 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  25.77 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  48.21 
 
 		 459 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  27.55 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  28.07 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  28.23 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  27.93 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  25.66 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  26.84 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  25.64 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  26.84 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  30.73 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  27.04 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.92 
 
 		 531 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.23 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 491 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  30.07 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  25.07 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  26.27 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  51.85 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  26.27 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.07 
 
 		 432 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  40.18 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  25.08 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  26.21 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 180 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 236 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 160 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  32.78 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  25.75 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.7 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.24 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  26.25 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  44.14 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.55 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 162 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.24 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  40 
 
 		 463 aa  79.3  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.5 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.62 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  28.14 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 173 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  41.12 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  40.2 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.2 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  31.43 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  38.32 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>