More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 
378 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  38.06 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  38.89 
 
 
302 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
308 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  55.47 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  54.29 
 
 
199 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  56.14 
 
 
190 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  56.3 
 
 
116 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  36.22 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.83 
 
 
289 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.67 
 
 
374 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.78 
 
 
314 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  34.05 
 
 
243 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
180 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  38.37 
 
 
230 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  32.4 
 
 
241 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  30.37 
 
 
277 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  32.96 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  32.96 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  32.96 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  41.4 
 
 
182 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  31.72 
 
 
249 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  32.26 
 
 
249 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  45.89 
 
 
458 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.13 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
306 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.08 
 
 
275 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  30.81 
 
 
242 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.53 
 
 
1048 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  30.81 
 
 
242 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.6 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  50.49 
 
 
333 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
370 aa  90.1  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
447 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  40.32 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  37.11 
 
 
249 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  30.29 
 
 
252 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  28.51 
 
 
242 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.34 
 
 
331 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.66 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  29.67 
 
 
212 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
398 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  45.26 
 
 
269 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  31.35 
 
 
242 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.44 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  39.83 
 
 
472 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.98 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  40.87 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  35.42 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  43.62 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  37.19 
 
 
236 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
417 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
333 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  49.47 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.82 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.98 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  42.59 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.88 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  34.23 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  34.23 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  34.23 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  30.18 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  30.18 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  30.18 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  41.05 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  38.14 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  39.57 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  39.57 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  39.57 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.18 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  37.88 
 
 
181 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
501 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  37.29 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  40 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.67 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.76 
 
 
506 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  43.69 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>