More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1696 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  66.67 
 
 		 327 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  66.03 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  96.35 
 
 		 231 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  54.64 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  94.93 
 
 		 199 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  51.49 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  89.15 
 
 		 190 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 381 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.37 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 349 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.43 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  58.62 
 
 		 116 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  43.6 
 
 		 182 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  33.02 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  51.96 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 394 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 269 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.54 
 
 		 388 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 366 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 453 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 378 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.84 
 
 		 429 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.74 
 
 		 1048 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  50.39 
 
 		 374 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42.48 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 447 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 256 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.41 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 417 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.75 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  45 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 452 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  43.59 
 
 		 467 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 467 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.75 
 
 		 265 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  41.13 
 
 		 346 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  48.15 
 
 		 347 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 469 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 469 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 469 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 517 aa  89  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 472 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.69 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  30.52 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.23 
 
 		 388 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 162 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  40.74 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  41.88 
 
 		 475 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 463 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 475 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.54 
 
 		 438 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 475 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.12 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 469 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  47.2 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  41.3 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 467 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 164 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.74 
 
 		 475 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.3 
 
 		 366 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.5 
 
 		 217 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 501 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  45.05 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 478 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.19 
 
 		 210 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  36.9 
 
 		 248 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  49.46 
 
 		 495 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  40.77 
 
 		 400 aa  85.9  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 479 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 248 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>