More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2750 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  90.77 
 
 
231 aa  243  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  90 
 
 
199 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  89.15 
 
 
302 aa  233  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  49.64 
 
 
308 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  58.12 
 
 
308 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.15 
 
 
378 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  60 
 
 
116 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  47.45 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  51.52 
 
 
180 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  51.79 
 
 
374 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  43.18 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  50.94 
 
 
345 aa  95.5  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.5 
 
 
370 aa  95.5  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.02 
 
 
1048 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
394 aa  91.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
284 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
331 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  50 
 
 
333 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.65 
 
 
332 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
388 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  48.42 
 
 
398 aa  88.6  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.37 
 
 
329 aa  88.6  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.99 
 
 
307 aa  88.2  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
453 aa  88.2  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
417 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  43.7 
 
 
517 aa  87.8  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
269 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
269 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.86 
 
 
273 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
495 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
337 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46 
 
 
331 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 
318 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.59 
 
 
388 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
333 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
452 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  42.86 
 
 
267 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
432 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  47.17 
 
 
347 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
278 aa  84.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
334 aa  84.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  52.21 
 
 
323 aa  84.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.74 
 
 
475 aa  84.7  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
501 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.15 
 
 
438 aa  84.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  49.43 
 
 
335 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.34 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  43.1 
 
 
253 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  43.1 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.69 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  47 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  45 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40.17 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.44 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  50 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
472 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
469 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
373 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  49.49 
 
 
317 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.52 
 
 
475 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
475 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
475 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.28 
 
 
366 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.19 
 
 
337 aa  80.9  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  40.71 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.55 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.81 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  37.96 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  41.59 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  49.02 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
256 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
256 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.42 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
225 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
256 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
469 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
463 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
479 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
333 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  45 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  48.94 
 
 
375 aa  78.2  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>