More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4077 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  100 
 
 		 308 aa  613  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  54.23 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  53.23 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  47.74 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  38.49 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 349 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.23 
 
 		 378 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.56 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  54.29 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.81 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  50 
 
 		 199 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  57.39 
 
 		 180 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  35.06 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  49.64 
 
 		 190 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  55.65 
 
 		 116 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  53.1 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  33.66 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  32.24 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.15 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  55 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  47.89 
 
 		 182 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.46 
 
 		 417 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  55.14 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  52.76 
 
 		 429 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 378 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  44.91 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 162 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  47.11 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.07 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  49.59 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  46.28 
 
 		 501 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 517 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 374 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  38.12 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 236 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  37.5 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.77 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  50.93 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  46.85 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.94 
 
 		 1048 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  49.51 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  45.83 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  47.75 
 
 		 467 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.36 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 467 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.71 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.59 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  46.73 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 469 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 469 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 469 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.83 
 
 		 210 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  50.5 
 
 		 174 aa  95.9  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  42.28 
 
 		 221 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 467 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.87 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.07 
 
 		 459 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 469 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  44.07 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.87 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 447 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  38.41 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  43.24 
 
 		 472 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.41 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.28 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 469 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  43.24 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 458 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  52.04 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  38.96 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  41.98 
 
 		 370 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  38.96 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>