More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5292 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  75.05 
 
 
469 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  71.13 
 
 
467 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  100 
 
 
469 aa  949    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  100 
 
 
469 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  71.13 
 
 
467 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  99.36 
 
 
469 aa  944    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  93.6 
 
 
469 aa  857    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  75.11 
 
 
467 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  61.34 
 
 
472 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  58.39 
 
 
475 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  58.39 
 
 
475 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  58.39 
 
 
475 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  54.17 
 
 
478 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  53.8 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  53.35 
 
 
479 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
432 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  62.25 
 
 
256 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  62.25 
 
 
256 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  58.6 
 
 
248 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
257 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
257 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
257 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
256 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
256 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  61.27 
 
 
256 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  62.75 
 
 
256 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  53.28 
 
 
248 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  62.87 
 
 
225 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  54.63 
 
 
241 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  54.63 
 
 
241 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  54.63 
 
 
221 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  57.67 
 
 
253 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  52.22 
 
 
239 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  53.14 
 
 
230 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  52.43 
 
 
228 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  60.84 
 
 
164 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  61.81 
 
 
505 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  62.41 
 
 
427 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  30.83 
 
 
498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  51.3 
 
 
249 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  47.1 
 
 
388 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
204 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
214 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  42.29 
 
 
204 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  42.29 
 
 
204 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  37.44 
 
 
208 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
388 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
394 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
340 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.3 
 
 
337 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  46.96 
 
 
447 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
625 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.71 
 
 
531 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.11 
 
 
388 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
308 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
458 aa  95.1  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
372 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.03 
 
 
372 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
372 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.66 
 
 
337 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
417 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
378 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.48 
 
 
438 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
180 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40 
 
 
321 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  43.59 
 
 
302 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
370 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  38.74 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  40 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
231 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
199 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.22 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.85 
 
 
1048 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  37.93 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  30.57 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  35.46 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  40.31 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  43.1 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  39.1 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.35 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  36.36 
 
 
546 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.19 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  35.19 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  37.4 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.5 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  38.4 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  31.96 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  33.77 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.87 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.29 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>