More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5687 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  89.45 
 
 
256 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  87.94 
 
 
257 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  87.94 
 
 
257 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  87.94 
 
 
257 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  86.72 
 
 
256 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  98.57 
 
 
248 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  78.91 
 
 
256 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  78.91 
 
 
256 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  82.98 
 
 
248 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  78.89 
 
 
225 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  92.07 
 
 
164 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  65.74 
 
 
221 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  67.79 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  67.79 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  65.22 
 
 
230 aa  274  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  64.88 
 
 
239 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  64.25 
 
 
228 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  62.25 
 
 
469 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  61.95 
 
 
469 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
469 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
469 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  61.46 
 
 
469 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  61.35 
 
 
467 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  61.35 
 
 
467 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  61.76 
 
 
467 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  61.8 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  60.61 
 
 
475 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  60.61 
 
 
475 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  60.61 
 
 
475 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  56.48 
 
 
472 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  57.97 
 
 
472 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  56.06 
 
 
478 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  53.77 
 
 
479 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  54.11 
 
 
432 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  60.15 
 
 
427 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  50 
 
 
505 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  52.74 
 
 
249 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  47.13 
 
 
498 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  39.57 
 
 
214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
204 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  43.35 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  43.35 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  40.11 
 
 
208 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  44.97 
 
 
388 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
388 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.78 
 
 
388 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.26 
 
 
491 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  49.59 
 
 
411 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.62 
 
 
204 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.52 
 
 
329 aa  88.6  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  36.7 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
337 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  36.09 
 
 
625 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  44.93 
 
 
495 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.73 
 
 
438 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.74 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
502 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
452 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
180 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
308 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  38.84 
 
 
447 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.55 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.34 
 
 
531 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.86 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  41.9 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.17 
 
 
1048 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
190 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
417 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 
368 aa  79  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.8 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  34.68 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.9 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.78 
 
 
476 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
535 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  34.75 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  35.77 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  34.45 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.85 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  40 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.52 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>