More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3442 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  100 
 
 
546 aa  1095    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.77 
 
 
329 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  32.89 
 
 
337 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  44.62 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  44.62 
 
 
392 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  43.08 
 
 
392 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  46.15 
 
 
541 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  42.75 
 
 
359 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  43.85 
 
 
445 aa  103  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  46.61 
 
 
360 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  39.31 
 
 
357 aa  101  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.61 
 
 
288 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  47.06 
 
 
137 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  40.57 
 
 
332 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  47.62 
 
 
538 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  44.7 
 
 
379 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  45.83 
 
 
286 aa  97.1  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.04 
 
 
399 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  41.3 
 
 
375 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
388 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  40.88 
 
 
384 aa  94.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  41.67 
 
 
302 aa  94  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.75 
 
 
442 aa  93.6  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  44.09 
 
 
477 aa  93.6  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  51.43 
 
 
351 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.54 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.75 
 
 
376 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.55 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.27 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
625 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  41.41 
 
 
402 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  44.35 
 
 
299 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  41.54 
 
 
318 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  45.22 
 
 
292 aa  91.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  43.85 
 
 
316 aa  91.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.75 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  39.55 
 
 
318 aa  92  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  28.95 
 
 
358 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  42.06 
 
 
498 aa  91.3  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  43.85 
 
 
290 aa  91.3  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.23 
 
 
313 aa  90.9  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40 
 
 
454 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  44.04 
 
 
283 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  41.09 
 
 
430 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  41.22 
 
 
305 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  43.38 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  41.48 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  42.42 
 
 
332 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  41.54 
 
 
328 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  36.42 
 
 
414 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.46 
 
 
455 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  48.57 
 
 
348 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  42.28 
 
 
309 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40.6 
 
 
379 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.88 
 
 
305 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  49 
 
 
448 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  40.52 
 
 
253 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  41.18 
 
 
305 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  42.62 
 
 
299 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40.16 
 
 
482 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40.16 
 
 
299 aa  87  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.88 
 
 
305 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.88 
 
 
305 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  41.8 
 
 
299 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  38.93 
 
 
229 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  37.67 
 
 
330 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  40.98 
 
 
299 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.98 
 
 
375 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  41.8 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  41.8 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40.16 
 
 
527 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  41.8 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  41.8 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  39.37 
 
 
377 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.21 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  37.41 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  44.44 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  40 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  37.41 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  42.31 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  44.95 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  39.23 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  38.46 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  38.1 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  41.27 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  43.64 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.31 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  36.02 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  41.8 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  40 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.73 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  40.15 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.52 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  37.12 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  41.94 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  40 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.3 
 
 
162 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  38.64 
 
 
305 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  43.64 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  41.82 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>