More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3253 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  100 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  80.09 
 
 		 208 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  54.46 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  54.02 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  54.02 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  49.04 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  42.61 
 
 		 475 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 475 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 475 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  41.36 
 
 		 479 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  42.05 
 
 		 472 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  41.48 
 
 		 467 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 467 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 472 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  40.64 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  40.64 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  40.64 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  40.84 
 
 		 478 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  42.29 
 
 		 432 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  40.64 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 469 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  38.5 
 
 		 469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  40 
 
 		 467 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  41.14 
 
 		 256 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  41.14 
 
 		 256 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  43.58 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  40.11 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 469 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 469 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.5 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  38.86 
 
 		 505 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  36.46 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  36.46 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  36.46 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  38.01 
 
 		 427 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  35.63 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  33.15 
 
 		 498 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  30.77 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  31.25 
 
 		 553 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  31.61 
 
 		 1048 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.25 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.96 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  31.87 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 502 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  26.83 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.14 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  30.38 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.37 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.76 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  30.36 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  33.33 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 295 aa  62  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40 
 
 		 333 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.75 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  39.24 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.78 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  44.59 
 
 		 366 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 458 aa  61.6  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  32.94 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  44.78 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  44.59 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  31.91 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  40 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  32.94 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.75 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  38.75 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.65 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.09 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  38.82 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  35.44 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  41.11 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  40.26 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  37.35 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  39.24 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>