More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2085 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  100 
 
 		 447 aa  850    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  32.46 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  31.4 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  45 
 
 		 625 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  49.21 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  42.86 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  30 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  45.22 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  33.23 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  26.54 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  43.51 
 
 		 501 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.7 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  31.52 
 
 		 517 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 308 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 505 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 231 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  45.04 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.7 
 
 		 337 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 502 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.6 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.68 
 
 		 332 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 374 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 269 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 293 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40 
 
 		 278 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.86 
 
 		 266 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 199 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.93 
 
 		 378 aa  90.5  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 350 aa  90.1  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 225 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 340 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  39.55 
 
 		 267 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.59 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 180 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 269 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.97 
 
 		 335 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  36.57 
 
 		 236 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  39.5 
 
 		 241 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 241 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.55 
 
 		 210 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 256 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 257 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 257 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 257 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 221 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  29.83 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  38.84 
 
 		 256 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 256 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 256 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 345 aa  87.4  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 256 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 256 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 248 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  36.09 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  34.71 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36.57 
 
 		 162 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 230 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 164 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.2 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  39.34 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.58 
 
 		 531 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.43 
 
 		 176 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.72 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 188 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  37.01 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  37.01 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  37.68 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  37.68 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>