More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2452 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  99.1 
 
 
221 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  85.85 
 
 
230 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  74.15 
 
 
228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  72.33 
 
 
239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  69.71 
 
 
225 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  64.57 
 
 
256 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  64.57 
 
 
256 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  64.09 
 
 
256 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  64.09 
 
 
256 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  62.95 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  67.31 
 
 
248 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  62.81 
 
 
253 aa  279  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  63.23 
 
 
257 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  63.23 
 
 
257 aa  278  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  63.23 
 
 
257 aa  278  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  63.68 
 
 
256 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  63.68 
 
 
256 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  57.6 
 
 
472 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  58 
 
 
475 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  58 
 
 
475 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  58 
 
 
475 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  54.84 
 
 
472 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  55.77 
 
 
467 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  55.77 
 
 
467 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  54.63 
 
 
469 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  54.63 
 
 
469 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  55.09 
 
 
469 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  54.63 
 
 
469 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  54.9 
 
 
469 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  53.24 
 
 
467 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  54.55 
 
 
479 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  53.54 
 
 
478 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  64.63 
 
 
164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  47.09 
 
 
432 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
505 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  51.41 
 
 
498 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  52.63 
 
 
427 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  50.77 
 
 
249 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  38.5 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  36.46 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  37.97 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  37.97 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  37.29 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
388 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.65 
 
 
388 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
388 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
452 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  39.5 
 
 
447 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.27 
 
 
438 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.1 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.78 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  36.52 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
317 aa  81.6  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  36.43 
 
 
625 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  39.1 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  40.57 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  46.79 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  36.07 
 
 
502 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.53 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  32.68 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  36.19 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  34.82 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  35.14 
 
 
417 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  38.79 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  36.21 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  26.4 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.14 
 
 
531 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  34.11 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.59 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.7 
 
 
390 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  37.84 
 
 
302 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.96 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  35.19 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.75 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.24 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  35.48 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.06 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  30.54 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  41.57 
 
 
487 aa  72.8  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  35.83 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
463 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  31.67 
 
 
1048 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  29.38 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  35.45 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  35.83 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  31.15 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  35.83 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>