More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2717 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  100 
 
 
204 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  100 
 
 
204 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  99.02 
 
 
204 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  57.67 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  56.34 
 
 
208 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  47.21 
 
 
249 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  40.1 
 
 
475 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  40.1 
 
 
475 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  40.1 
 
 
475 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  43.02 
 
 
479 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  42.53 
 
 
472 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  41.38 
 
 
467 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
467 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  41.95 
 
 
478 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
472 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
469 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  41.11 
 
 
469 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
469 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
469 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
469 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
225 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
432 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
257 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
257 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
257 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.77 
 
 
256 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  41.62 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  41.62 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  41.04 
 
 
248 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  41.04 
 
 
164 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  39.31 
 
 
256 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  39.31 
 
 
256 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  41.62 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  39.88 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  40.8 
 
 
253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
221 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  36.36 
 
 
241 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
241 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
505 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  38.32 
 
 
427 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  32.84 
 
 
230 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  34.44 
 
 
228 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  33.53 
 
 
498 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  33.74 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.57 
 
 
388 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  34.57 
 
 
549 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
502 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.71 
 
 
292 aa  72  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  48.15 
 
 
317 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  43.62 
 
 
491 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.82 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  53.09 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.56 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.19 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  47.44 
 
 
411 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  29.68 
 
 
388 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  49.23 
 
 
553 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.05 
 
 
372 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
393 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
495 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.33 
 
 
321 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  32.98 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.78 
 
 
370 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  48.15 
 
 
359 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.93 
 
 
531 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.54 
 
 
295 aa  62  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.73 
 
 
340 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  44.58 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.79 
 
 
342 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  45.68 
 
 
368 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
347 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
257 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.57 
 
 
391 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.25 
 
 
329 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.44 
 
 
476 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
308 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  31.93 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  45.68 
 
 
362 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.48 
 
 
487 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.44 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  45.68 
 
 
362 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  31.45 
 
 
1048 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
150 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  34.83 
 
 
452 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40.28 
 
 
366 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  42.65 
 
 
384 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  37.36 
 
 
346 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  38.54 
 
 
480 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  40.96 
 
 
347 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.81 
 
 
337 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.71 
 
 
372 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  37.96 
 
 
366 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  42.17 
 
 
348 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>