More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3662 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  100 
 
 
228 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  78.17 
 
 
230 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  72.9 
 
 
221 aa  314  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  74.4 
 
 
241 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  74.4 
 
 
241 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  61.4 
 
 
256 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  61.4 
 
 
256 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  62.61 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  62.61 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  62.77 
 
 
257 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  62.77 
 
 
257 aa  266  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  62.77 
 
 
257 aa  266  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  62.83 
 
 
256 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  62.28 
 
 
256 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  63.94 
 
 
248 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  60.26 
 
 
248 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  63.37 
 
 
239 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  63.29 
 
 
225 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  60.27 
 
 
253 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  56.5 
 
 
475 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  56.5 
 
 
475 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  56.5 
 
 
475 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  51.61 
 
 
472 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  53.02 
 
 
472 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  52.43 
 
 
469 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  52.58 
 
 
469 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  51.21 
 
 
467 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  51.21 
 
 
467 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  53 
 
 
478 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  52.11 
 
 
469 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  52.11 
 
 
469 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  52.11 
 
 
469 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  51.22 
 
 
467 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  52.5 
 
 
479 aa  214  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  59.76 
 
 
164 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  49.74 
 
 
432 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  54.14 
 
 
427 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  46.26 
 
 
505 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  46.84 
 
 
498 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  49.61 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
388 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  40.58 
 
 
388 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.6 
 
 
388 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  35.63 
 
 
214 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  35.56 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  35.23 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.4 
 
 
452 aa  95.1  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  35 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  35 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  39.52 
 
 
204 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  47.58 
 
 
411 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.14 
 
 
337 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40 
 
 
438 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  37.12 
 
 
625 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  39.23 
 
 
495 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  36.03 
 
 
476 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
308 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.68 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.09 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  36.62 
 
 
535 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  44.94 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.56 
 
 
531 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  32.91 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.82 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.8 
 
 
1048 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.43 
 
 
340 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  30.32 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  35.66 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.4 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.48 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  35.19 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  35.21 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  35.65 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  28.97 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  34.17 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  38.4 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  37.62 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.5 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  33.96 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  36.79 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.39 
 
 
390 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
398 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  35.59 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 
368 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  39.36 
 
 
395 aa  72  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  36.04 
 
 
491 aa  72  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.62 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  34.02 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  36.84 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>