More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1344 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  100 
 
 		 207 aa  430  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  58.16 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  60.25 
 
 		 188 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  54.02 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  57.76 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  62.5 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  45.39 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.86 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.38 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.2 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.2 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.2 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  44.54 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.86 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.86 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.86 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.86 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  37.24 
 
 		 221 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.56 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  50.88 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  37.16 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  32.5 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.27 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.15 
 
 		 150 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.4 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 154 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  46.02 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  36.48 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  36.25 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 333 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  37.25 
 
 		 363 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 363 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.19 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 363 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38.36 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  36.6 
 
 		 354 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  45.87 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  45.87 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  35.95 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  42.15 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1100  NLP/P60 protein  44.62 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 269 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  45.87 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  47.24 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.62 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  37.5 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  40.15 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  35.95 
 
 		 353 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  36.76 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  35.48 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  37.91 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  43.44 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  41.67 
 
 		 404 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1233  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.783126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 365 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 407 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 365 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 407 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 424 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 407 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 407 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  36.6 
 
 		 407 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 418 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.8 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  41.13 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  43.44 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  43.22 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  45.22 
 
 		 267 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  45.22 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  35.29 
 
 		 407 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  34.87 
 
 		 369 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>